ИММУНОЛОГИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ
Omics технологии
|
В 2000-2015-х г.г. появились и сложились в систему новые методы научно-клинических лабораторных исследований,
объединённые термином «omics». Omics - движущая сила современного развития, позволяющая изучать практически
любые биометрические параметры на молекулярном уровне (ДНК, РНК, протеины, липиды, малые молекулы и др.).
Сегодня - это современный методологический уровень медико-биологических исследований в мире: |
GENOMICS |
|
|
EPIGENOMICS |
|
|
◦ TRANSCRIPTOMICS |
|
◦ IMMUNOLOGY/td> |
◦ PROTEOMICS (IMMUNOMICS, SECRETOMICS) |
◦ IMMUNOPHENOTYPING |
LIPIDOMICS |
|
|
GLYCOMICS |
|
|
METABOLOMICS |
|
|
MICROBIOMICS |
|
|
|
Genomics - секвенирование целого генома, которое позволяет
идентифицировать функциональные варианты и потенциальные мультигенные взаимодействия.
Epigenomics - это изучение, направленное на обратимые изменения
того, как организм читает свои гены, когда происходит синтез белков. Технологии epigenomics включают оценку ДНК
метилирования, модификаций гистонов, ремоделирования хроматина и позволяют транслировать данные в специфические
и воспроизводимые анализы. Эпигенетические модификации и их сигнатуры зависят от внешних факторов и не приводят
к повреждению генов.
Transcriptomics – это исследование таких генных продуктов как совокупность РНК,
включая некодирующие РНК. Технологии transcriptomics концпентрируются на изучении транскрипта одной клетки
(single-cell RNA sequencing) путём цитометрии, что позволяет идентифицировать регионы ДНК, которые кодируют
специфические белки, важные для иммунных процессов.
Proteomics - изучение протеома - совокупности продуктов генов,
создаваемых или модифицируемых ДНК клетки, системы или целого организма. Технологии proteomics понижают порог
чувствительности анализов белков, включают мультиплексные иммуноанализы, масс-спектрометрию MALDI-TOF, жидкостную
хроматографию в сочетании с нано-масс-спектрометрией (nano-LC-MS/MS), мультиплексный иммуноанализ биомаркеров
белков (PEA).
Immunomics - изучение иммунома, т.е. всей совокупности антигенов
и молекулярных паттернов в интерфейсе иммйнных процессов, включая такие процессы как иммунорегуляция,
иммуноинтервенция и вакцинация. Технологии immunomics разделяет подходы genomics и proteomics.
Secretomics - вариант proteomics, который исследует секретом -
совокупность секретируемых белков.
Immunophenotyping включает использование многоцветной проточной
флюорометрии и масс-спектрометрии для идентификации клеток. Гейтирование - это
последовательная селекция и цитометрический анализ клеточных субпопуляций по выбранным маркерам.
Lipidomics предполагает изучение всех липидов, синтезируемых
как в отдельной клетке, так и системе и целом организме. Эти технологии включают использование жидкостной
хроматографии и масс-спектрометрии (liquid chromatography tandem-mass spectrometry, LC-MS).
Glycomics - изучение гликома (сахаров и карбогидратов).
Metabolomics - исследование метаболома, т.е. таких генных
продуктов как энзимы, а также метаболических процессов и метаболитов, включая малые молекулы. Технологии
metabolomics включают ядерный магнитный резонанс (NMR), масс-спектрометрию (MS), анализ внеклеточных потоков
гликолиза и окислительного фосфорилирования.
Microbiomics - изучение микробиома, т.е. совокупности
микробных сообществ в различных специфических экологических нишах. Эти технологии включают 16S РНК-секвенирование
и метагеномное секвенирование для идентификации вида микробов.
©В.В.Климов
|
|