ИММУНОЛОГИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ

Omics технологии

В 2000-2015-х г.г. появились и сложились в систему новые методы научно-клинических лабораторных исследований, объединённые термином «omics». Omics - движущая сила современного развития, позволяющая изучать практически любые биометрические параметры на молекулярном уровне (ДНК, РНК, протеины, липиды, малые молекулы и др.). Сегодня - это современный методологический уровень медико-биологических исследований в мире:

  GENOMICS    
  EPIGENOMICS    
  ◦ TRANSCRIPTOMICS   ◦ IMMUNOLOGY
  ◦ PROTEOMICS
    (IMMUNOMICS, SECRETOMICS)
  ◦ IMMUNOPHENOTYPING
  LIPIDOMICS    
  GLYCOMICS    
  METABOLOMICS    
  MICROBIOMICS    

Genomics - секвенирование целого генома, которое позволяет идентифицировать функциональные варианты и потенциальные мультигенные взаимодействия.
Epigenomics - это изучение, направленное на обратимые изменения того, как организм читает свои гены, когда происходит синтез белков. Технологии epigenomics включают оценку ДНК метилирования, модификаций гистонов, ремоделирования хроматина и позволяют транслировать данные в специфические и воспроизводимые анализы. Эпигенетические модификации и их сигнатуры зависят от внешних факторов и не приводят к повреждению генов.

Transcriptomics – это исследование таких генных продуктов как совокупность РНК, включая некодирующие РНК. Технологии transcriptomics концпентрируются на изучении транскрипта одной клетки (single-cell RNA sequencing) путём цитометрии, что позволяет идентифицировать регионы ДНК, которые кодируют специфические белки, важные для иммунных процессов.
Proteomics - изучение протеома - совокупности продуктов генов, создаваемых или модифицируемых ДНК клетки, системы или целого организма. Технологии proteomics понижают порог чувствительности анализов белков, включают мультиплексные иммуноанализы, масс-спектрометрию MALDI-TOF, жидкостную хроматографию в сочетании с нано-масс-спектрометрией (nano-LC-MS/MS), мультиплексный иммуноанализ биомаркеров белков (PEA).
Immunomics - изучение иммунома, т.е. всей совокупности антигенов и молекулярных паттернов в интерфейсе иммйнных процессов, включая такие процессы как иммунорегуляция, иммуноинтервенция и вакцинация. Технологии immunomics разделяет подходы genomics и proteomics.
Secretomics - вариант proteomics, который исследует секретом - совокупность секретируемых белков.
Immunophenotyping включает использование многоцветной проточной флюорометрии и масс-спектрометрии для идентификации клеток. Гейтирование - это последовательная селекция и цитометрический анализ клеточных субпопуляций по выбранным маркерам.

Lipidomics предполагает изучение всех липидов, синтезируемых как в отдельной клетке, так и системе и целом организме. Эти технологии включают использование жидкостной хроматографии и масс-спектрометрии (liquid chromatography tandem-mass spectrometry, LC-MS).
Glycomics - изучение гликома (сахаров и карбогидратов).
Metabolomics - исследование метаболома, т.е. таких генных продуктов как энзимы, а также метаболических процессов и метаболитов, включая малые молекулы. Технологии metabolomics включают ядерный магнитный резонанс (NMR), масс-спектрометрию (MS), анализ внеклеточных потоков гликолиза и окислительного фосфорилирования.
Microbiomics - изучение микробиома, т.е. совокупности микробных сообществ в различных специфических экологических нишах. Эти технологии включают 16S РНК-секвенирование и метагеномное секвенирование для идентификации вида микробов.

©В.В.Климов